A topografia de Carapebus apresenta cerca de 20% de superfície plana formada por restingas e lagoas, com utilização para a pecuária e cerca de 80% de superfície ondulada com utilização predominante de monocultura de cana-de-açúcar.
O Canal Campos–Macaé, é um canal artificial que interligava as cidades Macaé e Campos dos Goytacazes. O canal corta os atuais municípios de Campos dos Goytacazes, Quissamã, Carapebus e Macaé, além do Parque Nacional da Restinga de Jurubatiba. O canal foi concebido principalmente como uma hidrovia para transporte do açúcar produzido na região de Quissamã e Carapebus, que até então era transportado até ao porto de Imbetiba (Macaé) por carros de bois ou por via marítima através da lagoa Feia, do canal das Flexas e da barra do Furado.
Em épocas de cheia do canal, a Estrada de Imbiú fica intransitável, dificultando a mobilidade da população local e de mercadorias.